Самый популярный экспонат Музея истории ВМФ – 90-метровая дизельная подлодка Б-396 «Новосибирский Комсомолец», служившая в 80-90е гг. в Средиземном, Баренцевом море, Северном Ледовитом и Атлантическом океанах.
Советская дизель-электрическая подводная лодка проекта 641Б «Сом», установленная в парке «Северное Тушино» на берегу Химкинского водохранилища в Москве, является жемчужиной Музея истории ВМФ.

В подводной лодке семь отсеков. Посетители могут самостоятельно пройтись по всем отсекам, увидеть вооружение, контрольно-измерительную аппаратуру, приборы управления, спасательный гидрокостюм подводника, корабельную рынду, каюту капитана, спальные места команды, личные вещи экипажа.
В подводной лодке полностью сохранены шесть торпедных аппаратов, а также часть мин и торпед. Центральный пост управления лодкой превращен в экспозиционный зал, в котором посетители могут ознакомиться с условиями жизни экипажа.

Участникам необходимо иметь при себе распечатанный билет. Граждане, имеющие льготы, должны предъявить соответствующий документ, подтверждающий их. Дети до 14 лет включительно могут посетить экспозицию только в сопровождении взрослых.