Детская музыкальная школа № 98 Ленинградского района города Москвы открыта с 1 августа 1988 г. на базе Школы общего музыкального образования № 48 (работала с 1967 года, по адресу ул. Фестивальная д. 61б) на основании приказа Главного управления культуры исполкома Моссовета г. Москвы от 14 июня 1988 г. и решением Ленинградского райсовета г. Москвы от 29 июня 1988 г. № 438.
Школа зарегистрирована в качестве юридического лица Департаментом общественных и межрегиональных связей правительства Москвы за № 4572-2 от 29 сентября 1995 года с наименованием Детская музыкальная школа № 98 города Москвы.
Школа была переименована в Государственное бюджетное образовательное учреждение дополнительного образования детей города Москвы «Детская музыкальная школа № 98» (ГБОУДОД города Москвы «ДМШ № 98») приказом Департамента культуры города Москвы № 849 от 01.12.2011 г.
11 августа 2016 года школа была переименована в Государственное бюджетное учреждение дополнительного образования города Москвы «Детская музыкальная школа № 98» (ГБУДО города Москвы «ДМШ № 98») приказом Департамента культуры города Москвы № 668.
За годы работы в школе получили образование более 1300 учеников. В настоящее время в школе обучается 280 учащихся по 18 специализациям (фортепиано, баян, аккордеон, домра, балалайка, гитара, скрипка, виолончель, блок-флейта, флейта, кларнет, саксофон, труба, вокал академический, фольклор музыкальный, ударные инструменты, тромбон, тенор).