Музей книги является экспозиционным пространством отдела рукописей и книжных памятников Научной библиотеки ТГУ, который осуществляет свою деятельность как самостоятельное подразделение Научной библиотеки ТГУ с 1945 г. Отдел хранит редкие и особо ценные издания, рукописные книги, архивные документы, изобразительные материалы, имеющие научное, историческое и культурное значение.
Книжный фонд Научной библиотеки начал формироваться в 1880 г. одновременно с основанием первого сибирского вуза – Императорского Томского университета. Наиболее ценные коллекции: библиотека графа Г. А. Строганова, книжные собрания князя С. М. Голицына, поэта В. А. Жуковского, профессора и цензора А. В. Никитенко, министра внутренних дел П. А. Валуева, ученого и путешественника Г. Н. Потанина и др.
В Музее книги проводятся экскурсии и различные мероприятия.