С началом Гражданской войны 15 апреля 1918 Совнаркомом ДКР был назначен командующим 5 армией, затем командовал Царицынской группой войск, заместителем командующего и членом Военного совета Южного фронта, командующим 10-й армией (3 октября — 18 декабря 1918), наркомом внутренних дел УССР (январь — июнь 1919), командующим Харьковским военным округом, командующим 14-й армией и внутренним Украинским фронтом. За боевые заслуги в 1920 году награждён почётным революционным оружием. На VIII съезде РКП(б), проходившем в марте 1919 года, примыкал к «военной оппозиции». Группа от 10 человек. Необходима предварительная запись.