Искусство от императорской России до современности представлено в Губернаторском доме, построенном по указу Александра I в 1820-х годах и служившем резиденцией ярославских губернаторов, а также путевым дворцом императорских особ. Одна из драгоценных коллекций музея – коллекция ярославского портрета. Это произведения последней четверти XVIII – первой половины XIX века, написанные художниками, жившими в Ярославле и его окрестностях. Они создавали картины по заказу купцов и дворянских семей, опираясь на привозные образцы профессионального искусства и опыт житийных икон.

О жизни России рассказывают сюжеты художников-передвижников Ивана Крамского, Петра Верещагина, Василия Перова, Ильи Репина, братьев Маковских, Валентина Серова, Василия Верещагина. Посетители увидят уникальное собрание работ первого русского импрессиониста Константина Коровина. В музее – одиннадцать полотен, созданных художником после отъезда за рубеж в 1923 году. Это единственное в России собрание поздних картин Коровина.

Историю дома и губернии подчеркивает комплекс «Губернаторский кабинет-библиотека», в интерьере которого – мебель второй половины XIX века из особняка известных ярославских крахмалопаточных магнатов Понизовкиных. Среди главных ценностей – коллекция русского искусства XX века: от эталонных шедевров мастеров авангарда, произведений официального и альтернативного искусства советского периода до живописной анимации.